Beschleunigung der Suche nach einer wirksamen COVID-19-Heilung.

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Während der Wettlauf gegen die Zeit bei der Suche nach einem Medikament für COVID-19 weitergeht, setzt ein Expertenteam eine Supercomputing-Plattform ein, um den aktuellen Ausbruch zu bekämpfen und künftigen Pandemien effizient entgegenzuwirken.

Im Mittelpunkt dieser Bemühungen steht die Supercomputing-Plattform Exscalate (EXaSCale smArt pLatform Against paThogEns), ein Ergebnis des von der EU finanzierten ANTAREX-Projekts.

Die Plattform “nutzt eine ‘chemische Bibliothek’ von 500 Milliarden Molekülen dank einer Verarbeitungskapazität von mehr als 3 Millionen Molekülen pro Sekunde”, wie es in einer Pressemitteilung heißt.Das öffentlich-private Konsortium Exscalate4CoV (E4C) wird vom ANTAREX-Projektpartner Dompé Farmaceutici koordiniert.

In derselben Pressemitteilung heißt es: “Das E4C verfolgt ein doppeltes Ziel, nämlich Moleküle zu identifizieren, die gegen das Coronavirus (2019-nCoV) gerichtet sein können, und ein wirksames Instrument zur Bekämpfung künftiger Pandemien zu entwickeln, das im Laufe der Zeit konsolidiert werden soll”.

Die HPC-Plattform des E4C wird 3-D-Molekülstrukturen aufbauen, die von Wissenschaftlern genutzt werden können, um nachzuahmen, wie die Proteine des Krankheitserregers mit bestimmten Medikamenten interagieren.

Diese Aktivität hat bereits begonnen”, so die Pressemitteilung weiter.

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Die Supercomputing-Komponente des Projekts wird dann genutzt, um zukünftige Mutationen des Virus zu modellieren.

Diese Aktivitäten werden es ermöglichen, Kandidatenmoleküle zu identifizieren (entweder aus wiederverwendbaren Bibliotheken oder aus proprietären oder kommerziellen Substanzbibliotheken), die dann zur Prüfung bereitgestellt und/oder synthetisiert werden.

Parallel dazu sollen die E4C-Partner mit der Proteinproduktion für einige der identifizierten Sequenzen beginnen”.Zika-Virus und darüber hinausDie Exscalate-Plattform wird auch “externen Partnern zur Verfügung stehen, die bereit sind, bei der Drogenjagd zu kooperieren, wie zuvor beim Zika-Virus.

Dieser beträchtliche Aufwand, um etwa 25.000 Verbindungen zu testen, wird E4C….

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