Forscher verwenden genomische Daten zur Kartierung von Netzen der COVID-19-Übertragung, um Spitzenwerte für lokale Ausbrüche vorherzusagen.

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Forscher an der Georgia State University modellieren die globale Ausbreitung des SARS-CoV-2-Virus in Echtzeit, und ihre Visualisierungen von COVID-19-Ausbrüchen und Übertragungsnetzen auf der ganzen Welt zeigen einen wichtigen Aspekt auf: Wir sind wirklich miteinander verbunden, über alle Grenzen und Ozeane hinweg.Dr.

Pavel Skums, Assistenzprofessor für Informatik am College of Arts & Sciences, und Dr.

Gerardo Chowell, Professor für mathematische Epidemiologie an der School of Public Health, haben sich zusammengetan, um die schnelle globale Übertragung des neuen Coronavirus zu verfolgen, und ihre Ergebnisse Ende März in einem Vorabdruck auf medRxiv veröffentlicht.Anhand von viralen Genomen, die von Forschern aus der ganzen Welt gesammelt und ausgetauscht wurden, fanden sie heraus, wie das Virus kurz nach seinem Auftauchen in Wuhan, China, im November 2019 nach Asien, Westeuropa, Australien, Kanada und den Vereinigten Staaten und schließlich nach Südamerika und Afrika sprang.Skums hat ähnliche bioinformatische Techniken angewandt, um die Übertragung und den Ausbruch anderer Infektionen wie Hepatitis C zu verfolgen.

Er und Chowell verfügen nun über neue Werkzeuge und außergewöhnliche Datenmengen.

Die Schaffung eines globalen Übertragungsnetzes wie dieses ist möglich aufgrund der Fortschritte in der genomischen Sequenziertechnologie, die die Sequenzierung schnell und erschwinglich gemacht haben.”Die Daten über das Virus wachsen so schnell wie das Virus”, sagte Skums.

Dies ist tatsächlich der erste Ausbruch in der Geschichte, für den uns so viele Daten vorliegen.

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Es handelt sich um den ersten globalen Notfall im Bereich der öffentlichen Gesundheit, bei dem Sequenziertechnologien der nächsten Generation in so großem Umfang eingesetzt wurden.

Für Ebola hatten wir nichts in dieser Größenordnung”.Skums sagte, er habe zur Zeit von Ebola in den Centers for Disease Control and Prevention gearbeitet, und “Wissenschaftler reisten nach Afrika, um bei der Herstellung und Analyse der….

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