Wissenschaftliches Team findet neue, einzigartige Mutation in Coronavirus-Studie.

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Da die Coronavirus-Pandemie über die USA hinweggefegt ist, gibt es neben der Verfolgung der Zahl der täglichen COVID-Fälle auch eine weltweite wissenschaftliche Gemeinschaft, die sich mit der Verfolgung des SARS-CoV-2-Virus selbst beschäftigt.

Efrem Lim leitet ein Team an der ASU, das untersucht, wie sich das Virus im Laufe der Zeit ausbreiten, mutieren und anpassen kann.Um dem Virus weltweit auf die Spur zu kommen, verwendet Lims Team in der Genomik-Einrichtung der ASU eine neue Technologie, die als Sequenzierung der nächsten Generation bezeichnet wird, um schnell alle 30.000 chemischen Buchstaben des genetischen Codes von SARS-CoV-2, dem so genannten Genom, zu lesen.Jede Sequenz wird in einer weltweiten Genbank hinterlegt, die von einer gemeinnützigen wissenschaftlichen Organisation namens GISAID betrieben wird.

Bis heute sind über 16.000 SARS-CoV-2-Sequenzen in der EpiCoVTM-Datenbank von GISAID hinterlegt worden.

Die Sequenzdaten zeigen, dass SARS-CoV-2 aus einer einzigen Quelle aus Wuhan, China, stammte, während viele der ersten analysierten Fälle aus Arizona Reisen aus Europa als wahrscheinlichste Quelle aufwiesen.Nun hat Lims Team unter Verwendung eines Pools von 382 Nasenabstrichproben, die aus möglichen COVID-19-Fällen in Arizona gewonnen wurden, eine SARS-CoV-2-Mutation identifiziert, die zuvor nie gefunden worden war – wobei 81 der Buchstaben verschwunden sind und dauerhaft aus dem Genom gelöscht wurden.

Die Studie wurde in der Online-Version des Journal of Virology veröffentlicht.Lim sagt, sobald er die Manuskriptdaten auf einem Preprint-Server medRxiv zur Verfügung gestellt habe, sei das weltweite Interesse der wissenschaftlichen Gemeinschaft, darunter auch der Weltgesundheitsorganisation, geweckt worden.”Einer der Gründe, warum diese Mutation von Interesse ist, ist, dass sie eine große Deletion widerspiegelt, die beim SARS-Ausbruch 2003 entstanden ist”, sagte Lim, ein Assistenzprofessor am Biodesign Institut der ASU.

Während der mittleren und späten Phase der SARS-Epidemie akkumulierte SARS-CoV Mutationen, die die….

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